2009年上半年市级财政安排支持“农民专业合作组织”发展资金1300万元，以贷款贴息等方式积极支持农民专业合作社组织发展，并争取中央财政安排310万元对供销社领办的农民专业合作社和龙头企业的扶持，以提高农民专业合作组织能力和农民进入市场的组织化程度。
　　2009下半年，市级财政在生猪、蔬菜、柑橘等三个优势特色产业选定项目并及时拨付1000万元资金，主要支持农民专业合作组织改善生产基地基础设施、改良品种和开展标准化生产，重庆市农民专业合作社发展速度明显加快。一是2009年全市依法登记农民专业合作社1381个，其中供销系统引领发展农民专业合作社932个；全市农民专业合作社总数达到4546个，入社农户213万人，农民入合率达到29.8%，高出全国平均水平16个百分点，在全国名列前茅。二是专业合作社规模不断壮大。全市各级供销社共发展入社农户1000户以上、流转土地1000亩以上、销售收入1000万元以上的“三千型” 专业合作社742个，有效促进了当地产业的发展。三是农民专业合作社品牌化建设上了新台阶。目前，全市供销系统引领专业合作社创建农产品品牌773个，在工商部门登记注册的品牌有327个，入选全国总社“千社千品”富农工程的品种有320个。