当前农民专业合作社发展中还面临着各种各样的问题，总结起来就是“利小窄低散，缺少非盲慢”这十个字。

　　第一，利字当头。现在很多合作社的负责人，成立合作社的目的不单纯，功利心很强，社员和消费者的钱都想赚;

　　第二，规模小实力弱。现在工商登记注册的合作社很多，但真正有实力的合作社却没有几个。有些合作社8个人、10个人，股金没有多少，实力不强;

　　第三，业务范围窄。《农民专业合作社法》规定合作社有7种业务:生产资料的购买、农产品的销售和贮藏、农产品加工、农产品运输、技术服务、信息服务。实际上，把这些服务都能做到的合作社很少，有的合作社只能完成其中的一项功能，比如生产资料的购买。有的合作社就形同协会，只提供技术服务或信息服务;

　　第四，组织层次低。很多合作社基本上都集中在一个村里面，有的一个村里有好几个同类的合作社;

　　第五，力量分散，各自为战。这也主要是因为组织层次低的原因造成的;

　　第六，缺资金、人才少、不规范以及不懂法等问题，在合作社中表现也比较突出。

　　另外，政府政策落实滞后也严重阻碍了合作社的进一步发展壮大。

　　面对合作社存在的问题，我们应该从以下几个方面着手：

　　首先，合作社教育培训工作要抓紧。合作社人才存在一个“四少”的情况：1、合作社中有文化、懂技术、善经营、会管理、能合作、肯奉献的优秀带头人较少;2、合作社中了解合作社知识，甘于“利益共享、风险共担”的农民社员较少，基本上不了解合作社，，对自己加入合作社后的权利和义务都不清楚;3、行业指导部门中通法律、懂政策、会监管的指导人员较少;4、理论深厚、善于把国际先进经验和我国国情融会贯通、善于理论联系实践的教学科研人员较少。

　　政府和有关部门及合作社组织要高度重视合作社原则中的“教育、培训与信息”原则，高度重视人才培养工作，营造合作社教学科研的良好环境，积极开展合作社学历教育与非学历教育，为我国农民专业合作社将和建设与发展源源不断地培养既懂理论，又善实务的高层次专门人才。

　　其次，要支持鼓励合作社的联合与合作。合作社的发展之路之一在于合作社之间的合作，既生产者合作社与先飞合作社的合作，以产销对接，带动消费革命，进而也推动合作社的共赢。立足安全、安心，铸造合作社品牌。

　　目前我国的专业合作社比较多，要避免单打独斗，走规模化发展之路，合作社应该承担更多的功能。为此，合作社应该尽可能多地联合起来，建立专业合作社的联合社或联合会。一个合作社的力量太有限，可能为了要解决一个市场问题就已经非常困难。

　　当然，在市场问题上，政府也做了许多工作，比如现在都提倡农超对接。但是，单打独斗的合作社农超对接时也比较容易处于劣势。二而联合社能够实现规模生产，让合作社互学互助，引导合作社从产地型走向产业型，实现弄稀罕品的品牌效应。只有这样才能实现合作社在市场上的合法垄断，谈判地位才会提高。

　　最后，要正确看待农业合作社发展的双轨制问题。专业农业合作社和综合性的专业合作社各有优点，我们要正确看待他们的发展，不能只提倡一种模式。这两种模式各有优势，专业合作社的优点是可以按照不同品种或领域分别组建起来，能多样化的应对农产品市场。

　　而综合合作社的优越性则在于对于市场应对能力薄弱的分散经营的小农经济来说，通过合作与政策支援，可以使自己的经营(资金互助等)和生活(社会保障等)得以持续发展。